Antibiotici se kod životinja koriste zbog tri glavna razloga, a to su prevencija infekcija, poticanje rasta i liječenje mikrobnih infekcija. Posljednjih desetljeća raste svijest ljudi o važnosti upravljanja sustavima kontrole sigurnosti hrane, zbog sve veće prijetnje javnom zdravlju. Međutim prekomjerna ili neprikladna uporaba predstavlja problem. Kada se antibiotici prekomjerno koriste, na kraju postaju manje učinkoviti i za ljude i za životinje. Svaka primjena antibiotika rezultira pojavom ostataka antibiotika u životinjama za proizvodnju hrane. Ostaci antibiotika u hrani animalnog porijekla mogu biti uzrokovani i drugim načinima kao npr. onečišćenje okoliša te prijenos sa jedne na drugu životinju, a njihova asimilacija može potencijalno biti zdravstveno rizična. Postoji nekoliko analitičkih metoda koje se koriste za detekciju rezidua antibiotika u hrani, a mogu se podijeliti u dvije glavne skupine: potvrdne i orijentacijske metode. Pojedinci kao i pravne organizacije trebaju razvijati svijest o problemu ostataka antibiotika u hrani. Jedno od rješenja ovog problema je pronalaženje alternative za antibiotike npr. tvari biljnog porijekla i probiotika. Treba težiti smanjenju nepotrebne uporabe antibiotika kod životinja i razmotriti smanjenje preventivne upotrebe antibiotika. Glavni problemi uzrokovani ostacima antibiotika su razvoj antibiotske rezistencije, reakcija preosjetljivosti, kancerogenost, mutagenost, teratogenost i poremećaj normalne crijevne flore.